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MetaboScape为代谢组学数据处理工作提供持久的帮助！

布鲁克质谱

2021.1.05

面临的挑战

代谢组学领域已经开发了非常多的软件，以应对从原始数据到生物学解释的一系列特殊挑战。然而并非所有软件都能获得长期的支持，经常无法使用或以其它方式淘汰。因此，在工作流程中依赖这些软件可能会带来较大的风险。因此，在数据处理工作流程中对所有软件的持续支持显得至关重要。

解决的方案

MetaboScape为您的工作流程提供持续的支持，定期更新并通过用户提供的使用反馈来丰富软件功能。我们快速的开发周期确保我们始终处于数据采集和分析技术的最前沿。

MetaboScape提供了一套完整的工具，可帮助您处理包含大量代谢物的大型数据集。软件中提供的统计学分析、搜库标注和代谢通路绘制等功能大大增强了生物学相关代谢物的鉴定能力。布鲁克致力于维持对这些已集成的开源工具的支持，同时还将导出/导入功能扩展到其它代谢组学领域常用的工具。兼具了开源的灵活性和可信赖的持续性！

用户的支持

法国植物生物学研究所的Dimitri Heintz博士在谈到MetaboScape时说道：“我们非常喜欢MetaboScape的一点是，它并依赖于网站或开源工具。一旦我们使用开源程序开发了工作流程，有可能几周后这个程序就失效了，这意味着浪费时间和精力，我们不得不回到起跑线！由于我们要为研究团队和工业合作者“负责”，因此我们必须确保工作流程是可持续的，这一点上MetaboScape做的非常好。”

Dimitri Heintz 博士
法国植物生物学研究所

图1：代谢组学数据处理流程图

Dimitri Heintz博士同时兴奋的说道：“MetaboScape中包含非常多非靶向代谢组学数据处理的工具，而且简单易操作，即使对于没有生物信息学技能的人来说，也浅显易懂，通过图表界面来完成数据处理，用户也能很容易能访问数据处理的参数设置。这套完整的工具还包括提供对开源工具的支持，从而提高了数据处理的速度和效率。” 比如：

支持BioTrasformer，预测代谢物在系统中的生物转化

支持MetFrag，根据计算机模拟结果预测最有可能的代谢产物

支持专用文件导出，例如，GNPS进行基于化合物的分子网络分析，有助于解释相关的生物学信息。

参考文献

[1] Djoumbou FY, et al. (2019). Journal of Cheminformatics, 11:2DOI: 10.1186/s13321- 018-0324-5[2] Wolf S, et al. (2010). BMC Bioinformatics, 201011:148.DOI:10.1186/1471-2105-11- 148[3] Nothias LF, et al. (2020). Nature Methods, 17:905-908.DOI:10.1038/s41592-020- 0933-6

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周锦帆